La Oficina Antifraude de Cataluña ha colaborado y colabora con diversos organismos internacionales y redes anticorrupción de ámbito internacional y europeo. Desde 2011 es miembro de pleno derecho de la Asociación Internacional de Autoridades Anticorrupción (IAACA) y European Partners against Corruption (EPAC/EACN), las dos redes principales de colaboración e intercambio de experiencias en la prevención y la lucha contra la corrupción. Hasta 2016, Antifraude fue miembro del comité ejecutivo de la IAACA, cuyos estatutos fueron reformados en 2016, y ostentó la vicepresidencia de la EPAC/EACN.
Igualmente, Antifraude mantiene relaciones de intercambio y colaboración con los principales organismos internacionales, como la Oficina de las Naciones Unidas contra la Droga y el Crimen (UNODC), en especial en lo relativo a su programa de difusión de la Convención de las Naciones Unidas contra la Corrupción en las universidades (ACAD), la Organización para la Cooperación y el Desarrollo Económico (OCDE) —colaborando en tareas de asesoramiento a reformas institucionales de organismos anticorrupción y realizando aportaciones a proyectos normativos de aspectos clave en la lucha contra la corrupción—, así como con organismos europeos, en especial la Oficina Europea de Lucha contra el Fraude (OLAF).
Se han vehiculado numerosos convenios de colaboración con agencias anticorrupción de competencias análogas, a fin de llevar a cabo acciones bilaterales en el ámbito de la prevención y la corrupción, y del intercambio de buenas prácticas, a menudo contando con el apoyo de la plataforma TAIEX (Technical Assistance and Information Exchange) de la Comisión Europea para países en fase de preadhesión.
La Oficina Antifraude ha participado, juntamente con otras agencias europeas, en la puesta en marcha de proyectos financiados por la Unión Europea en el ámbito de la prevención de conflictos de interés (Proyecto HERCULE III), la prevención de la corrupción especialmente en el sector privado (Programa ISEC, liderado por el Ministerio de Justicia de Estonia), el Colegio Europeo de Investigaciones Financieras y Análisis Financiero Criminal (Programa ISEC, liderado por la Université de Management de Estrasburgo), y la promoción y el intercambio de buenas prácticas en la detección, la investigación y la sanción de la corrupción en la UE (Programa ISEC 2012), este último proyecto liderado de manera conjunta con el Servicio Central de Prevención de la Corrupción (SCPC) y con la Fiscalía Anticorrupción rumana. La Oficina también ha sido beneficiaria de alguno de estos proyectos.
Red de las Autoridades Europeas para la Integridad y la Protección de las Personas Alertadoras (NEIWA)
La Oficina Antifraude de Cataluña es miembro de la Red de las autoridades europeas para la integridad y la protección de las personas alertadoras(Network of European Integrity and Whistleblowing Authorities - NEIWA). La Red está integrada por autoridades de países miembros de la Unión Europea, países candidatos a la UE y países de la Asociación Europea de Libre Comercio (EFTA) que desempeñan un papel central en el ámbito de la protección de las personas alertadoras (denuncias , investigación, protección, apoyo, asesoramiento, prevención, educación y/o aplicación de la ley).
Informe anticorrupción de la UE de febrero de 2014 en el cual, dado que denuncia la ausencia de un enfoque global por parte del Estado español, cita a Cataluña como ejemplo de buena práctica por el hecho de haberse dotado de una agencia multidisciplinar, «la única en su género que existe en España»(pág. 16).
Adicionalmente, la Oficina Antifraude trabaja con diversas organizaciones de la sociedad civil, como Transparencia Internacional (TI), con proyectos como los índices de transparencia (de ayuntamientos, comunidades autónomas, diputaciones, parlamentos o empresas) y proyectos como ENIS, que hace una valoración del Sistema Nacional de Integridad español, o la evaluación del Lobby en España: análisis y propuestas.